20世纪70年代，全美有27家流感疫苗生产厂家。1976年之后，因为疫苗的利润本来就很低，还要冒被告的风险，一家又一家的疫苗生产厂家退出了流感疫苗生产领域，到最后只剩下3家，这3个厂家要承担每年8千万份流感疫苗的生产任务，而且政府不保证能够全部被使用，多余的由厂家包赔认倒霉。

美国政府对这种情况心知肚明，2002年，时任联邦健康和社会服务部部长的汤米•汤普森向国会申请一亿美元，在三年内改良美国的疫苗生产系统，主要用于研究借助分子生物学技术用细胞培养方法替代鸡胚。当年，国会没批一分钱，第二年，国会只批了他所申请金额的半数，第三年，国会将一亿美元如数批准，因为流感疫苗出现了短缺，引起了公众的恐慌。

2004年流感疫苗短缺事件也体现了美国疫苗供应系统的不堪大用，FDA对疫苗的消毒要求很严，给药厂造成严重的负担。为了减少成本，疫苗厂商之一的凯龙公司把流感疫苗生产厂设在英国。2004年，其生产的5千万人份疫苗中出现一种常见细菌污染，不得不全部扔到，导致美国流感疫苗出现严重短缺，在民众中引得极大的恐惧。

即使在这种情况下，美国国会对流感疫苗的研制和生产仍然不重视，而是着眼在所谓的生物恐怖威胁上，拨款56亿美元建立“生物盾牌2号”，主要针对天花和炭疽，买了7500份炭疽病疫苗和8000万份天花疫苗，这个计划还指定特别款项为药厂支付可能出现的诉讼费用。直到2005年10月，国会的注意力才集中在流感疫苗上。

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